La Touques recèle ainsi une importante population de salmonidés migrateurs tels que la truite de mer et, dans une moindre mesure, le saumon atlantique. Avec une remontée annuelle de plus de 5 800 truites de mer (2013), la Touques est la première rivière française voire Européenne de remontées de cette espèce. De ce fait, la Touques et ses affluents sont classés en Zone Naturelle d’Intérêt Écologique, Faunistique et Floristique (ZNIEFF).

 

Le paysage est très vallonné et dominé par le bocage. La Touques traverse en effet des habitats écologiques variés tels que des prairies humides, des marais, des côteaux calcaires et des secteurs boisés.